Episode summary

DNAをシリカビーズに封入し、3Dプリント可能な材料に混ぜることで、DNA入り3DオブジェクトをプリントするDNA-of-things (DoT)の技術と、DNA Storageと噴水符号化の技術について紹介しました。

Starring

soh
tadasu
coela

Show notes

• A DNA-of-things storage architecture to create materials with embedded memory. Koch et al., Nature Biotech (2019) … DNA-of-thingsのオリジナル論文。スタンフォードバニーちゃんの情報をDNAとして記録し、シリカビーズに入れて3Dプリンティング可能な材料に混ぜ込み、3Dオブジェクトを3Dプリンタによって作成するDNA-of-thingsの開発を行った。情報が劣化することなく、読み出しも問題なく行えた。DNAに情報を書き込む技術としてはDNA Fountain法を用いている。
• DNA Fountain enables a robust and efficient storage architecture. Erlich and Zielinski, Science (2017)… 噴水符号(Fountain Code)の技術をDNA Storageに応用した論文。DNA Storageのシャノン限界の見積もりや、過去のDNA Storage論文の比較を行っている。215Petabyte/gramで情報を埋め込むことができると推定している。
• DNA Fountain enables a robust and efficient storage architecture. Erlich and Zielinski, Biorixv (2016) … Biorxivに投稿されているバージョン。誰でもアクセス可能。
• シフト演算を利用した噴水符号 … 山口大学野崎先生による噴水符号に関する日本語説明記事
• WikipeDNA (researchat.fm ep18)
• Expansion Microscopy. Chen et al., Science (2015) … Ed Boydenらの技術。細胞に、膨らませることが可能なポリマーを染み込ませて膨らませることでこれまで観察不可能だった小さな構造が観察可能になった。超解像イメージングとは異なるアイデアから生まれた技術。
• Hachimoji DNA and RNA: A genetic system with eight building blocks. Hoshika et al., Science (2019) … 新しい人工塩基をつくることにより、4種類から8種類に拡張した論文。PCRしたり、DNA->RNAしたりすることが可能。

Editorial notes

• メリークリスマス！！フィギュアに紫外線やX線当てまくるアートが流行る！！(coela)
• たまきさんも論文を読んだみたいでよかった (soh)
• DNAを全てのオブジェクトに練りこんで、みんなハッピー！！！(tadasu)